大脑皮层的第二个输入是大脑旧部分所执行的运动指令的拷贝。例如,行走部分由脑干和脊髓的神经元控制。这些神经元也分裂他们的轴突为两个,一个分支产生的行为到旧的大脑和另一个到新皮层。另一个例子是眼球运动,它由一个被称为上丘的旧大脑结构控制。上丘神经元的轴突将其活动的拷贝发送到新皮层,让新皮层知道什么运动即将发生。这种运动整合是大脑的一种几乎普遍的特性。大脑皮层被告知大脑的其余部分产生什么样的行为以及传感器所感知的。想象一下如果大脑皮层没有被告知身体在某种程度上移动会发生什么。如果新皮层不知道眼睛即将移动,以及如何移动的,那么视神经的感受到的变化将被视为世界移动。事实上,我们的感知是稳定的,而眼睛移动告诉我们新皮层是依赖于眼球运动的知识。当你触摸、听到或看到某物时,大脑皮层需要区分由你自己的运动引起的感觉变化,而不是由世界运动引起的变化。你的传感器的大部分变化是你自己运动的结果。这种“感觉运动”的整合是大多数发生在新皮层的学习的基础。新皮层使用行为来学习世界的结构。